《图书馆的女友》是一部奇幻校园恋爱漫画，讲述男主周逸凡在图书馆借阅一本名为《恋之书》的旧书时，书中的女主角竟从书页中走出来，变成一个活生生的少女“书灵”。她自称是历代读者心愿所化，必须帮助周逸凡找到“真爱之书”才能回到书里。周逸凡一边应付学业，一边带着这个无知又可爱的书灵穿梭于图书馆，探寻书籍背后的秘密，渐渐对她产生了超越书页的感情。
周逸凡找到《恋之书》的最终章，书灵必须消失，两人在星空下的图书馆拥吻，书灵化作光点，却留下一句“我永远在你心里”。
他们发现图书馆深处有一本禁书，翻开后书灵的记忆被唤醒，原来她曾是百年前创作《恋之书》的女作家的思念化身。
书灵要收集三封“真实情书”才能维持形态，周逸凡帮她撮合同学，却闹出一连串搞笑误会。
一位神秘收藏家企图用魔法捕捉书灵，周逸凡奋不顾身救回她，两人在书架间奔跑，首次牵手。
周逸凡深夜回图书馆取落下的笔记，发现书灵在月光下读书，长发流淌，他被她的美震撼，心跳加速。
周逸凡翻开《恋之书》的刹那，一道光芒闪过，书灵穿着白裙坐在书架上，笑着问：“你就是我新的读者吗？”